区别：

定义上的区别：软件著作权，简而言之，是指软件的开发者或其他权利人依据相关著作权法律的规定，对软件作品所享有的各项专有权利。这主要涉及到软件代码的原创性和复制权等问题。

而专利权则是由政府机关或代表某些国家的区域性组织根据申请而颁发的一种法律文件。它主要保护的是那些具有新颖性、创造性和实用性的发明创造。获得专利的发明创造，在一般情况下，他人只有经过专利权人的许可才能进行实施或使用。

法律依据的差异：在法律依据方面，软件著作权主要依据的是《著作权法》和《计算机软件保护条例》，而专利权的保护则主要依赖于《专利法》和《中华人民共和国知识产权法》。这两者在法律条款、保护对象和维权手段上都有很大的不同。

申请流程与标准的区别：从申请的角度来看，软件著作权在软件编写完成后即可自然获得，无需经过特别的审核或批准。只要提交的材料符合规范，开发者就可以获得软件著作权。而专利的申请则需要经过形式审查和实际审查两个阶段，并且需要满足新颖性、创造性、实用性等多项要求才能获得保护。

保护力度的不同：在保护力度上，软件著作权主要保护的是软件代码的原创性和复制权，而专利权则更侧重于保护软件的核心构思和技术方案。这就意味着，即使有人复制了受著作权保护的软件代码，只要不涉及核心的技术构思，就不会构成对专利权的侵犯。

联系：

都属于知识产权：软件著作权和专利权都属于知识产权的一种，是保护创新成果的重要手段。

互补性：在某些情况下，软件著作权和专利权可以相互补充。例如，对于一些具有创新性的软件，既可以申请软件著作权保护其代码表达形式，又可以申请专利保护其技术方案。

共同促进技术创新：软件著作权和专利权的设立都是为了鼓励技术创新和知识产权保护，共同推动软件行业的发展。

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